Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.98□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.97□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms