Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms