Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd3Q9Z2D8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Mbd3Q9Z2D8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms