Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cldn8Q9Z260 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Cldn8Q9Z260 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms