Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VarsQ9Z1Q9 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VarsQ9Z1Q9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms