Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms