Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J3

Nfs1, Cysteine desulfurase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nfs1Q9Z1J3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfs1Q9Z1J3 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfs1Q9Z1J3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfs1Q9Z1J3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfs1Q9Z1J3 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfs1Q9Z1J3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nfs1Q9Z1J3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Nfs1Q9Z1J3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms