Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Cldn13Q9Z0S4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cldn13Q9Z0S4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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