Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E3

Aire, Autoimmune regulator, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AireQ9Z0E3 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
AireQ9Z0E3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
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AireQ9Z0E3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
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AireQ9Z0E3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
AireQ9Z0E3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
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