Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVC5

Trpc7, Short transient receptor potential channel 7, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc7Q9WVC5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Trpc7Q9WVC5 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Trpc7Q9WVC5 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trpc7Q9WVC5 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trpc7Q9WVC5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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