Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Snx1Q9WV80 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms