Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tnip1Q9WUU8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms