Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUH2

Lhx9, LIM/homeobox protein Lhx9, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx9Q9WUH2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Lhx9Q9WUH2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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