Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU00

Nrf1, Nuclear respiratory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrf1Q9WU00 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Nrf1Q9WU00 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Nrf1Q9WU00 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms