Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTP3

Spdef, SAM pointed domain-containing Ets transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpdefQ9WTP3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SpdefQ9WTP3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SpdefQ9WTP3 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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