Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Msantd2-204ENSMUST00000211060 2165 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Rian-215ENSMUST00000183180 633 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Tceal9-201ENSMUST00000048687 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Lhx6Q9R1R0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm11672-201ENSMUST00000140380 645 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 AC154757.2-201ENSMUST00000228885 743 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Lhx6Q9R1R0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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