Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1A8

Rfwd2, E3 ubiquitin-protein ligase RFWD2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfwd2Q9R1A8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rfwd2Q9R1A8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rfwd2Q9R1A8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.5 ms