Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tmed2Q9R0Q3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tmed2Q9R0Q3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms