Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sh2d3cQ9QZS8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sh2d3cQ9QZS8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms