Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Npas3Q9QZQ0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Npas3Q9QZQ0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms