Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChmlQ9QZD5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ChmlQ9QZD5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ChmlQ9QZD5 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms