Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZB6

Nr4a3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a3Q9QZB6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Nr4a3Q9QZB6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Nr4a3Q9QZB6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms