Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PnckQ9QYK9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms