Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT9

Znf354b, Zinc finger protein 354B, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354bQ9QXT9 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Znf354bQ9QXT9 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Znf354bQ9QXT9 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 175.8 ms