Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Limd1Q9QXD8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms