Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Lsm4Q9QXA5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms