Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Homer2Q9QWW1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms