Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PdcQ9QW08 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdcQ9QW08 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdcQ9QW08 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdcQ9QW08 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdcQ9QW08 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PdcQ9QW08 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms