Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
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Cln8Q9QUK3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
Cln8Q9QUK3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Cln8Q9QUK3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
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