Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Cdkl2Q9QUK0 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cdkl2Q9QUK0 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms