Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trappc2lQ9JME7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Trappc2lQ9JME7 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms