Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

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Length 504 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SrfQ9JM73 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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SrfQ9JM73 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SrfQ9JM73 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
SrfQ9JM73 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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