Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rabgef1Q9JM13 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Rabgef1Q9JM13 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rabgef1Q9JM13 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Rabgef1Q9JM13 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rabgef1Q9JM13 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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