Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLL3

Tnfrsf19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf19Q9JLL3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tnfrsf19Q9JLL3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms