Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tlr5Q9JLF7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tlr5Q9JLF7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms