Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cyp39a1Q9JKJ9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms