Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Cnga3Q9JJZ8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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