Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rb1cc1Q9ESK9 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rb1cc1Q9ESK9 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms