Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD7

Dysf, Dysferlin, mousemouse

Predictions only

Length 2,090 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DysfQ9ESD7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
DysfQ9ESD7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
DysfQ9ESD7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms