Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cmtm7Q9ESD6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms