Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES63

Usp29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, mousemouse

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Length 869 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp29Q9ES63 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
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Usp29Q9ES63 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Usp29Q9ES63 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Usp29Q9ES63 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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