Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES34

Ube3b, Ubiquitin-protein ligase E3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3bQ9ES34 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ube3bQ9ES34 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms