Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Stx12Q9ER00 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Stx12Q9ER00 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms