Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,011 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Rapgef4Q9EQZ6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Rapgef4Q9EQZ6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms