Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH7

Ndst3, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndst3Q9EQH7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ndst3Q9EQH7 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ndst3Q9EQH7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms