Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH3

Vps35, Vacuolar protein sorting-associated protein 35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps35Q9EQH3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vps35Q9EQH3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms