Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
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Cxcr6Q9EQ16 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cxcr6Q9EQ16 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
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Cxcr6Q9EQ16 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Cxcr6Q9EQ16 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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