Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Clstn1Q9EPL2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Clstn1Q9EPL2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms