Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rnft1Q9DCN7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Rnft1Q9DCN7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms