Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Tspan4Q9DCK3 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms